В Fallout 76 игроки могут получить мутации, которые обеспечивают его определёнными бонусами или способностями. Получить мутацию можно с помощью сыворотки или облучения радиацией. Стоит отметить, что мутация пропадёт, когда игрок начнёт очищать себя от радиации — и неважно, каким образом он мутировал.
Один из способов получить мутацию — прыгнуть в любой водоём. В воде уровень радиации непреклонно растёт (если у игрока нет перка на иммунитет к радиации в воде), быстро накапливаясь в персонаже. Получив определённую дозу, игрок получит случайную мутацию. Если игрок получит такую же дозу (и не умрёт), то он будет обладать двумя мутациями. Однако нужно помнить, что при очищении организма мутации удаляются, так что стоит выбирать: большой запас здоровья или бонусы к способностям.
Другой путь мутации — покупка сыворотки. Достаточно лишь найти базу Вайтспринг (Whitespring base) и купить любую желаемую сыворотку. Тут можно выбрать, какой мутацией себя одарить. После приобретения достаточно лишь употребить её. Игрок не получит радиации, но мутация по-прежнему исчезнет при попытке очистить свой организм. Другой минус — цена: единица сыворотки обойдётся примерно в 5000 крышек.
Перк Starched Genes позволяет не удалять мутации при очищении организма от радиации.
Ниже находится список всех известных мутаций в игре. Рядом указаны эффекты, от положительных к отрицательным: