В Shadow of the Tomb Raider сюжет берёт свое начало немного после событий Rise of the Tomb Raider. Находясь в Центральной Америке, Лара пытается разгадать тайну загадочного ящика, до которого, параллельно с ней, пытается добраться частная армия Trinity. Однако армия наёмников — не единственная проблема юной расхитительницы гробниц — именно в этой части Лара начнёт взрослеть и понимать, что её действия и приключения могут — и будут — иметь не всегда хорошие последствия.
В новой части больше времени будет уделено взаимодействию Лары с обычными людьми — Крофт сможет исследовать большие площади локаций, что открывает простор для общения с жителями.
Основными местами для исследования по-прежнему останутся обширные игровые зоны между заданиями. Игрок сможет находить гробницы, коллекции предметов, вражеские базы и прочие интересные места. Гробницы будут выполнены в исключительно тех стилях, которые соответствуют культурам тех районов. Так разработчики дают дань уважения культуре народа, на локация которого они находятся.
Лара также значительно преобразилась с начала своего путешествия в Tomb Raider — она научилась новым приёмам и отточила свое мастерство в борьбе с противниками — в дополнение к своему ледорубу, она научилась применять новые техники скрытных атак. Спрятавшись в кустах, Лара может дождаться противника и быстро и тихо ликвидировать его.
Но главным всё равно будет вопрос внутреннего противоречия — по ходу развития событий Лара начнёт понимать последствия своих действий и усомнится сама в себе. Разработчики из Eidos Montreal уверены, что новые события Лары станут самыми тяжёлыми для расхитительницы гробниц. Shadow of the Tomb Raider поможет понять, кто такая Лара Крофт и кем её сделали её приключения.