Теорий заговора вокруг Metal Gear Solid 5 было очень много, некоторые живы и по сей день. Одна из них касается незавершенности игры, ее 51 миссии и мифической третьей главы, которую Кодзиме (Hideo Kojima) не дали закончить.
Видеозапись игрового процесса 51 миссии попала на диск с закадровыми материалами коллекционного издания The Phantom Pain, игроки решили, что ее попросту вырезали, не дав поклонникам узреть настоящий финал саги. Но Konami непреклонна:
51 миссия, о которой вы говорите, совершенно точно не является концовкой. Игру всегда планировали завершить именно на 50 миссии. То, что было на диске — всего лишь запись ранней версии, которая в то время была в разработке. Нет никаких дополнений, они не планируются. Открытые сюжетные линии продолжатся в следующих играх серии Metal Gear.
В свою очередь, Kotaku и другие журналисты утверждают, что видео, попавшее на диск с коллекционным изданием, очень важно для Metal Gear Solid 5 и серии в целом.