Это приквел оригинальной Slave Zero, вышедшей в 1999 году. Действие игры разворачивается за пять лет до событий, показанных в первой части. Мегасити С1-9 управляет великий Хан, который терроризирует население с помощью управляемых им живых машин. Группа повстанцев хочет прекратить тиранию, и использует оружие врага против него самого. Воины захватывают одного из биомехов и переманивают на свою сторону.
В игре есть битвы с боссами, специальный режим для тренировок, а также эндгейм-контент — процедурная башня «Каштелу-Вермельо», где игроки смогут посоревноваться за лидерство в онлайн-таблице.