Mary Skelter 2 — продолжение атмосферной ролевой игры с пошаговыми боями и видом от первого лица в японском стиле. События развиваются в вымышленном мире, где человечество приняло поражение у армии инопланетных захватчиков, и было заключено в живые башни, что служат тюрьмой. Вы вступите в группу революционного движения, которая сражается за свободу ещё живых людей. Тюрьма появилась несколько лет назад вместе с обрушением города вокруг нее.
Теперь по её залам бродят смертоносные существа, известные как Марчены, и коварные Кошмары. Оцуу и Русалочка являются частью группы людей, известных как «Рассвет», пытающихся пережить эти ужасы. Им удается спасти Алису и молодого человека по имени Джек в одной из миссий. Однако по возвращении на базу Алиса сходит с ума и начинает нападать на окружающих. Она ранит Джека, который пытался защитить Оцуу и Русалочку. Но позже они приходят в себя и обнаруживают Джека на грани смерти...