New Super Luigi U — основная сюжетная линия почти идентична сюжетной линии NSMBU, за исключением Марио. Игрок управляет Луиджи , чтобы пройти каждый уровень слева направо, чтобы достичь конца, обозначенного флагштоком. На уровнях есть различные враги и опасности, мешающие прогрессу. Уровни также содержат бонусыкоторые дают Луиджи новые способности при сборе; например, Огненный цветок позволяет Луиджи бросать огненные шары, а костюм белки-летяги позволяет Луиджи парить в воздухе. Каждый уровень содержит три «звездные монеты», которые служат коллекционными предметами. Уровни разделены на восемь «миров», и в них происходят встречи с одним из восьми купалингов.