Final Fantasy Agito — в начале игрок настраивает своего персонажа: выбирает его облик и оружие, а потом приступает собственно к игре в качестве кадета Двенадцатого класса Академии. Игрока сопровождает мугл, в дальнейшем можно будет ездить на чокобо. Можно взаимодействовать с NPC: студентами и учителями. Игрок также может создавать связи, играя в мини-игры и общаясь с членами Класса Ноль из Final Fantasy Type-0, за исключением Махины Кунагири и Рем Токимия. Игра разделена на миссии, выполняемые одним игроком, а в финале каждой части существует многопользовательский этап с уничтожением босса. После каждого столкновения действия игроков оцениваются, и на основе этих оценок они переводятся в новый класс.