WWE Smackdown! Here Comes the Pain — в играх появилась более сложная система захватов, при этом сохранился быстрый геймплей серии. Наряду с новой системой захватов впервые появились индикаторы повреждений тела и счетчики подчинения (как для того, кто применяет прием, так и для того, кто вырывается из приема), а также возможность разорвать захват при касании канатов и индивидуальные шкалы персонажей, состоящие из статистических данных (таких как сила, выносливость и скорость). В Here Comes the Pain также впервые в рестлинг-игре были представлены матч Elimination Chamber и матч в лифчиках и трусиках.