Pokémon Pinball — перед началом игры игрока просят выбрать один из двух столов: красный или синий. На каждом столе игровой процесс немного отличается.
Игровой процесс игры во многом повторяет игровой процесс традиционного пинбола. Нужно как можно дольше продолжать игру и не дать шарику упасть за флипперы. Каждый стол состоит из нескольких уровней, на котором можно определить, какого покемона можно будет поймать. Чтобы запустить шар (в игре он выглядит в виде покебола, устройства, которыми пользуются тренеры покемонов), нужно нажать кнопку A. При сталкивании шара с определёнными препятствиями игроку начисляются очки. Кроме того, стол можно толкать, чтобы шар поменял положение, а также управлять флипперами.