Naruto: The Broken Bond — является файтингом и в то же время платформером. Геймплей от прошлой части не сильно изменился. Графика в игре стала ярче и красивее, обновились модели персонажей. Почти у каждого персонажа есть комбо, на конце которых он использует дзюцу. Например Саскэ использует огонь, а Итати — взрывных клонов. Обычных же комбо-ударов стало больше. Видеоролики в игре прорисованы на движке игры, поэтому в некоторых из них нужно быстро нажимать клавишу для выполнения определенных действий. Если же клавиша не была нажата вовремя, то видеозаставка начнётся заново, или с определённого момента.
Сюжет игры затрагивает события с 81 серии по 135 (т.е заканчивается там, где и заканчивается оригинальная манга). Включает в себя возвращение Итати Утихи, поиски Цунадэ, битву трёх Саннинов и миссию по возвращению Саскэ. Однако большую часть кампании приходится выполнять побочные миссии (драться с безличными бандитами, выполнять поручения горожан).