Metroid — героиня, Самус Аран — галактический охотник за головами. Она одета в исключительно мощный и приспособляемый экзоскелет, созданный древней расой Чозо. Улучшения для костюма, собранные за время прохождения, не переносятся в следующую часть игры, поэтому в каждой части их необходимо собирать заново. Метроиды — большие желеобразные существа с четырьмя клеточными ядрами. Они могут высасывать жизненную энергию из любого живого организма, в процессе чего жертва обычно гибнет.