Gateways — платформер с элементами головоломки, в котором ученый исследует огромную лабораторию, наполненную множеством загадок. Можно использовать телепорты, чтобы прыгать из одного места в другое, менять размер предметов, сражаться с врагами, ходить по стенам и потолкам и даже путешествовать во времени, чтобы помогать своему персонажу в прошлом. Во время исследования уровней нужно собирать различные бонусы, которые улучшат навыки главного героя.