Dungeon Keeper: The Deeper Dungeons — группа Рыцарей, каким-то образом избежавших вашей чистки, воскресила Аватара. Они отвоевали множество пещер, которые вы не завоевали, и реформируют свою армию. Вам предстоит помешать им свергнуть вашу победу и править королевством. Улучшения искусственного интеллекта включают в себя вражеских Хранителей, продающих свои ловушки и двери, когда они остро нуждаются в золоте. Они также ведут себя более скупо, и их способность находить золото значительно улучшилась. Также улучшен искусственный интеллект существ.
Существа теперь не телепортируются в области, которые их хозяин еще не исследовал. Отряды, потерявшие своего лидера, теперь выбирают нового и продолжают свою миссию. Есть также несколько новых тайлсетов подземелий.