Age of Empires 3: The WarChiefs — теперь доступны 2 народа Северной Америки: Ирокезы, Сиу и 1 народ Центральной Америки: Ацтеки. При игре за любую из них вы начинаете с 5 работниками. Более того — индейские работники могут строить городские управы (у европейцев это действие доступно только исследователю). У каждой их постройки есть особое улучшение («большая кнопка»), предлагающее бонусы в виде поставок юнитов или ресурсов. Еще одной особенностью всех трех держав является то, что с самого начала игры вы можете видеть все торговые посты на карте.